基于SRAP标记构建野生香菇核心种质库

编号 zgly0001540116

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SRAP标记构建野生香菇核心种质库

作者 刘俊  马超君  向星洁  李闯  边银丙  张健  肖扬 

作者单位 华中农业大学应用真菌研究所  湖北长久菌业有限公司 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 S646.12 

关键词 香菇  相关序列扩增多态性  遗传多样性  核心种质库 

文摘内容 以95份野生香菇(Lentinula edodes)种质和1份栽培种质为材料,在利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记开展遗传多样性分析的基础上,采用属性约简启发式算法和逐步聚类位点优先取样法分别构建核心种质。两种方法分别得到35份(Core 1)和29份(Core 2)种质,其核心种质保留比分别为36.5%和30.2%,位点保留比分别为100%和94.7%。基于有效等位基因数,Nei’s基因多样性指数,香农信息指数等四个参数对两组核心种质进行t测验,结果显示两组核心样本均能很好的代表原始种质的遗传多样性,但Core1具有更高的位点保留比例且地理来源更加广泛,确定为代表96个原始菌株的核心种质库。