杧果MGAPDH同源基因的克隆及其表达分析

编号 zgly0001397145

文献类型 期刊论文

文献题名 杧果MGAPDH同源基因的克隆及其表达分析

作者 罗聪  何新华  胡颖  谭超  欧世金 

作者单位 广西大学农学院  广西作物遗传改良与生物技术重点实验室 

母体文献 果树学报 

年卷期 2011年06期

年份 2011 

分类号 S667.7 

关键词 杧果  甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)  表达分析  序列分析 

文摘内容 甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)是糖代谢和能量代谢过程中的关键酶。根据GAPDH基因保守序列设计PCR引物,利用RT-PCR和改良RACE技术,首次从杧果中分离克隆出MGAPDH同源基因的cDNA全长序列。该序列全长为1 356 bp,开放阅读框为1 203 bp,编码401个氨基酸。利用分子生物学软件对MGAPDH蛋白进行生物信息学分析,结果显示:MGAPDH蛋白分子量为42.8 ku,等电点为8.9;该蛋白包含2个功能域,即NADB_Rossmannsuperfamily和Gp_dh_C superfamily;MGAPDH蛋白不含信号肽序列和跨膜结构,是非分泌蛋白,位于叶绿体中。氨基酸序列进化分析结果显示,杧果MGAPDH蛋白可能与光合作用有关。半定量分析显示,杧果MGAPDH同源基因在杧果不同组织中均表达,并且表达水平差异不明显,说明杧果MGAPDH同源基因可作为杧果基因差异表达的内参基因。