基于16S rRNA测序的海南坡鹿肠道菌群结构分析

编号 zgly0001652036

文献类型 期刊论文

文献题名 基于16S rRNA测序的海南坡鹿肠道菌群结构分析

作者 王悦  苏力  陈兴永  陈武  田秀华  杨锴斌 

作者单位 庆元县林业局  广州动物园  东北林业大学  浙江凤阳山-百山祖国家级自然保护区百山祖管理处 

母体文献 野生动物学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 Q95  Q93 

关键词 海南坡鹿  肠道菌群  16SrRNA 

文摘内容 通过构建菌群16S rRNA基因克隆文库和进行系统发育分析,对采集自广州动物园健康成年海南坡鹿的16个粪便样品的菌群结构和多样性进行分析,结果表明海南坡鹿粪便菌群分属于18个菌门,其中厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是核心菌门,分别占比50. 49%和36. 52%。海南坡鹿肠道菌群中丰度最高的前10个属分别为5-7N15丰度值为7. 181%、普雷沃菌属(Prevotella,3. 159%)、密螺旋体属(Treponema,2. 788%)、琥珀酸弧菌属(Succinivibrio,2. 545%)、颤螺菌属(Oscillospira,2. 304%)、CF231丰度值1. 843%、瘤胃球菌属(Ruminococcus,1. 652%)、艾克曼菌属(Akkermansia,1. 439%)、甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter,1. 340%)、梭菌属(Clostridium,1. 333%)。对比不同性别海南坡鹿(Cervus eldi hainanus)肠道菌群,通过t检验,统计出具有差异显著(P <0. 05)的属共17个。