成年商品猪肠道可培养核心菌群的结构与组成分析

编号 zgly0001746947

文献类型 期刊论文

文献题名 成年商品猪肠道可培养核心菌群的结构与组成分析

作者 田野  蔡淳理  杨大容  李慧  刘宝生 

作者单位 江西农业大学动物科学技术学院  四川农业大学动物医学院  江西农业大学兽药研究所 

母体文献 家畜生态学报 

年卷期 2022,43(10)

页码 36-44

年份 2022 

分类号 S828  S852.6 

关键词 肠道菌群  成年猪  多样性分析  可培养菌  菌群结构  聚类分析 

文摘内容 为探明成年商品猪肠道可培养核心菌群的结构与分布,该研究从3头健康成年商品猪的6个肠段17个肠节段中通过普通培养的方法,共分离筛选出355株可培养核心菌,并进行16S rDNA全序列扩增、测序,通过Mothur软件的OTU聚类及NCBI的在线比对进行分析。结果显示,成年猪肠道中的可培养核心菌群绝大部分属于Proteobacteria和Firmicutes两菌门,其中Escherichia、Bacillus、Proteus 3个菌属丰度最高,占全部检出率的80%;Escherichia coli、Bacillus amyloliquefaciens、Shigella、Bacillus和Proteus mirabilis 5个菌种是广泛分布于商品猪肠道各肠段的共有菌种。菌群的OTU聚类分析结果与NCBI在线比对结果存在明显差别,说明当前单纯的OTU聚类分析并不能完全取代菌群基因数据库的直接比对。