基于microRNA深度测序的猕猴桃性别分化初探

编号 zgly0000989776

文献类型 期刊论文

文献题名 基于microRNA深度测序的猕猴桃性别分化初探

学科分类 220.35;野生动物保护与管理

作者 闫明科  徐强  刘春燕  张琼  姚小洪 

作者单位 中国科学院武汉植物园  中国科学院种质创新与特色农业重点实验室  中国科学院大学  上饶职业技术学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2015(7)

页码 1260-1272

年份 2015 

关键词 猕猴桃  microRNA  深度测序  性别分化 

文摘内容 利用新一代高通量测序技术,对猕猴桃雌花和雄花中表达的小RNA进行了测序,分别得到雌花18 408 610条序列和雄花11 191 469条序列。通过生物信息学分析,共鉴定和预测得到39个保守mi RNA家族和400个新的mi RNA家族,其中有170个mi RNA家族在雌、雄花样品间显著差异表达。对差异表达mi RNA进行靶基因的预测及注释,结果显示,靶基因产物具有包含核苷三磷酸水解酶的磷酸环结构域的mi RNA数量最多。在猕猴桃25号连锁群(Chr25)上共预测得到3个mi RNA,其中novel-ach-mi R362的靶基因Achn298021可能与猕猴桃花的性别发育有关。