禾谷炭疽菌RGS蛋白生物信息学分析

编号 zgly0000889391

文献类型 期刊论文

文献题名 禾谷炭疽菌RGS蛋白生物信息学分析

作者 韩长志 

作者单位 西南林业大学林学院 云南省森林灾害预警与控制重点实验室 

母体文献 微生物学通报 

年卷期 2014(8)

页码 1582-1594

年份 2014 

关键词 禾谷炭疽菌  G蛋白信号调控因子  信号肽  二级结构  炭疽菌属 

文摘内容 【目的】明确禾谷炭疽菌中存在的典型RGS,及其信号肽、跨膜区、二级结构特征,明确该菌RGS与其他病菌之间的关系,最终为深入开展RGS定位、功能研究打下坚实的理论基础,也为进一步开展其他炭疽菌的研究提供重要的理论指导。【方法】基于酿酒酵母中已经报道的4个典型RGS序列,利用BLASTp以及关键词对禾谷炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,以及通过SMART保守结构域分析。同时,通过对禾谷炭疽菌中典型RGS氨基酸序列进行细胞信号肽、跨膜区结构以及二级结构等生物信息学分析,此外,通过对禾谷炭疽菌中的典型RGS与其他物种中的同源序列进行遗传关系比较分析。