希金斯炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析

编号 zgly0000940228

文献类型 期刊论文

文献题名 希金斯炭疽菌GPCR蛋白生物信息学分析

作者 韩长志 

作者单位 西南林业大学林学院  云南省森林灾害预警与控制重点实验室 

母体文献 华中师范大学学报;自然科学版 

年卷期 2015(2)

页码 246-251

年份 2015 

关键词 希金斯炭疽菌  G蛋白偶联受体  信号肽  二级结构  炭疽菌属 

文摘内容 希金斯炭疽菌可以侵染诸多十字花科植物引起炭疽病,给各国农业生产造成了巨大经济损失.GPCR作为生物体内G蛋白信号转导途径中的重要感知蛋白,在信号传递过程中发挥着重要作用.本研究基于酿酒酵母中已经报道的3个典型GPCR序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,以及通过TMHMM、HMMTOP跨膜结构域分析,明确该菌存在4个典型的GPCR;同时,通过对上述氨基酸序列进行细胞信号肽、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,明确上述GPCR均具有较高比例的α螺旋结构以及均不含有明显的信号肽序列;在定位方面,4个GPCR均定位在质膜上。