达乌尔黄鼠线粒体Cyt b基因序列特征及其系统进化分析

编号 zgly0001626953

文献类型 期刊论文

文献题名 达乌尔黄鼠线粒体Cyt b基因序列特征及其系统进化分析

作者 王静  纪维红  徐长林  苏军虎 

作者单位 兰州职业技术学院  甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心  甘肃农业大学-新西兰梅西大学草地生物多样性研究中心  InstituteofNaturalandMathematicalSciencesMasseyUniversity 

母体文献 草原与草坪 

年卷期 2016年03期

年份 2016 

分类号 Q953 

关键词 达乌尔黄鼠  线粒体  遗传多样性  Cytb 

文摘内容 在甘肃省天祝藏族自治县采集12只达乌尔黄鼠(Spermophilus dauricus),PCR产物直接测序获得Cyt b基因1140bp序列,采用Clustal X 1.84、MEGA 6.0、Dna SP 5.0等生物信息学软件进行了序列特征和系统地位分析。结果显示,达乌尔黄鼠Cyt b基因含116个多态信息位点,群体中多态位点类型有转换、颠换,Cyt b基因T,C,A,G碱基含量分别为33.7%,25.9%,27.6%,12.9%。基于Kimura双参数的遗传距离显示,属内种间大黄鼠(Spermophilus major)与新疆黄鼠(Spermophilus fulvus)间遗传距离最小(0.034),高加索黄鼠(Spermophilus musicus)与达乌尔黄鼠最大(0.172),达乌尔黄鼠群体内遗传距离为0.140,种群分化较大,基于NJ法构建的系统进化树符合传统分类标准,研究为达乌尔黄鼠Cyt b基因标记的种群遗传学应用提供了参考。