茶尺蠖小RNA病毒5′端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小RNA病毒的比较分析

编号 zgly0001282784

文献类型 期刊论文

文献题名 茶尺蠖小RNA病毒5′端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小RNA病毒的比较分析

作者 王小纯  张珈敏  蒋洪  俞海洋  谭莉  胡远扬 

作者单位 武汉大学生命科学学院  武汉大学生命科学学院  武汉大学生命科学学院  武汉大学生命科学学院  武汉大学生命科学学院  武汉大学生命科学学院 武汉430072  河南农业大学农学院  郑州450002  武汉430072  武汉430072  武汉430072  武汉430072  武汉430072 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2004年05期

年份 2004 

分类号 Q785 

关键词 茶尺蠖小RNA病毒  哺乳动物小RNA病毒  5′端非编码区  结构分析 

文摘内容 用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropisoblique小RNA病毒 (EoPV)中提取病毒基因组RNA ,逆转录后加poly(dT) ,然后进行两步PCR扩增基因组 5′端。克隆测序后 ,对其 5′端非编码区的核苷酸序列进行分析 ,发现具有哺乳动物小RNA病毒的 5′端非编码区的一些特征 :A T含量丰富、起始密码子上游AUG和小顺反子多。利用mfold预测了EoPV 5′端非编码区的二级结构 ,存在4个茎环结构 ,有哺乳动物内部核糖体进入位点 (IRES)的保守区域 ,即含保守基序GNRA的茎环A和A C丰富的环B及多聚嘧啶区域。据此推测EoPV基因组翻译采用IRES起始机制。