10种观赏植物查尔酮合成酶基因生物信息学分析

编号 zgly0000823993

文献类型 期刊论文

文献题名 10种观赏植物查尔酮合成酶基因生物信息学分析

学科分类 220.5010;园林植物学

作者 张太奎  刘峥  朱芳明  张汉尧 

作者单位 西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室 

母体文献 西部林业科学 

年卷期 2013(5)

页码 62-68

年份 2013 

分类号 Q78 

关键词 观赏植物  查尔酮合成酶  基因  蛋白质  生物信息学 

文摘内容 运用分子生物学软件对金花茶、菊花、杜鹃、荷花、金银花、贯叶金丝桃、牡丹、龙胆、桃树、兜兰10种观赏植物的查尔酮合成酶基因(CHS)进行核酸序列预测和分析, 采用邻接距离矩阵法构建了系统发育树, 并进行系统发育分析, 结果表明, (1)观赏植物查尔酮合成酶基因所编码蛋白质为稳定的疏水性单链蛋白质, 以仪一螺旋和无规则卷曲为主; (2)可能在游离核糖体上合成后不经蛋白转运, 直接在细胞质基质的特定部位中行使催化功能; (3)查尔酮合成酶的作用机制可能与组织特异性和发育阶段以及对外界不同刺激敏感程度相关; (4)查尔酮合成酶基因具有超基因家族, CHS基因在进化中存在基因重复与分歧, 其保守性好, 除桃树有2个外显子, 其余植物只有1个外显子, 且几种植物的CHS外显子剪切位点不同; (5)龙胆与其他植物的关系较远, 杜鹃与金花茶、牡丹与菊花的关系都较近。