亚麻荠NBS类抗病基因家族的鉴定与分析

编号 zgly0001566290

文献类型 期刊论文

文献题名 亚麻荠NBS类抗病基因家族的鉴定与分析

作者 孙岩  刘宝玲  苑丽霞  薛金爱  贾小云  李润植 

作者单位 山西农业大学  晋中学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S435.659 

关键词 亚麻荠  抗病基因  NBS家族  基因簇  生物信息学 

文摘内容 NBS类抗病基因是植物中最大的一类抗病基因。亚麻荠是一种新型能源及特用油料作物,抗病、虫、杂草及逆境能力极强。然而,有关其抗性分子机理鲜有报道。本研究采用NB-ARC标准结构域的HMM模型,对亚麻荠本地蛋白质数据库进行检索分析,在全基因组水平上鉴定NBS类抗病基因。结果表明亚麻荠基因组共有472个NBS类抗病基因,分布于17条染色体上,56%的基因成簇分布。所有串联重复基因也都以基因簇的形式出现,这表明串联重复有利于基因簇的形成。系统发生树分析显示TIR-NBS-LRR(TNL)和CC-NBS-LRR(CNL)两类亚家族的抗病基因可能在进化过程中遵循不同的进化路径,导致其在应对病原菌侵染时发挥不同的功能。本研究发现将为鉴定新的植物抗病基因和解析亚麻荠高抗病机制提供科学参考。