1个白草花叶病毒分离物的全基因组序列分析(英文)

编号 zgly0001291882

文献类型 期刊论文

文献题名 1个白草花叶病毒分离物的全基因组序列分析(英文)

作者 邓丛良  黄金光  高文娜  吕玉峰  范在丰  李怀方 

作者单位 北京出入境检验检疫局植物检疫实验室  中国农业大学植物病理系植物病毒研究室  中国农业大学植物病理系植物病毒研究室 北京100026  北京100094  北京100094 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2005年S1期

年份 2005 

分类号 S432.41 

关键词 白草花叶病毒  分离物  序列比较  核苷酸 

文摘内容 从我国北方地区呈现花叶症状的白草上分离得到1个白草花叶病毒分离物(AY642590,PenMV-B),测定了其RNA的核苷酸全序列。结果发现,该病毒分离物的RNA基因组全长共9 611个核苷酸,5′-末端和3′-末端的非翻译区序列分别为172和241个核苷酸,中间为9 198个核苷酸的开放读框,编码3 065个氨基酸,分子量约为349 575 Da;其多聚蛋白P3/6K1处的E/H蛋白切割位点序列与Potyvirus属其他病毒均不相同,为该病毒所仅有。预期的Potyvirus属病毒的一些重要的、功能性保守基序特征都存在于该病毒的基因组序列中。Potyvirus属病毒多聚蛋白氨基酸序列的系统进化树分析表明,PenMV-B和MDMV,SrMV,SCMV有较近的亲缘关系。根据ICTV最新的马铃薯Y病毒属分类标准,进一步确定该病毒具有Potyvirus属SCMV亚组新成员的分类地位。对SCMV亚组病毒和分离物基因组各区域的多重序列比较结果表明,PenMV在进化过程中有可能发生了基因的重组和变异。