毛果杨全基因组硝酸根转运蛋白家族(NRT2s)序列分析

编号 zgly0000806983

文献类型 期刊论文

文献题名 毛果杨全基因组硝酸根转运蛋白家族(NRT2s)序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 袁丁  李红  罗志斌 

作者单位 西北农林科技大学生命科学学院  西北农林科技大学植物保护学院  西北农林科技大学林学院 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2012(5)

页码 80-86

年份 2012 

分类号 S792.11 

关键词 氮素营养  硝酸根  转运蛋白  毛果杨  序列分析 

文摘内容 以拟南芥(Arabidopsis thaliana)和莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardttii)高亲和性硝酸根转运蛋白(NRT2s)为对照,对毛果杨(Populus trichocarpa)NRT2s家族成员进行序列比对、系统发育分析、基因结构分析、理化性质预测、疏水性与跨膜区预测、结构域检测等生物信息学分析。结果表明: 毛果杨基因组包含6个NRT2s家族成员并可分为3个亚家族。其中PtNRT2.1、PtNRT2.2和PtNRT2.3属于亚家族I;PtNRT2.4和PtNRT2.5属于亚家族II;PtNRT2.6属于亚家族III。亚家族I保守程度最高,亚家族II和III可能由亚家族I进化而来。所有的NRT2s都具有高度相似的结构域、功能区和基因结构,在不同物种中的进化较为保守。不同的NRT2s成员定位于不同的亚细胞结构中,其具体功能可能存在差异,并共同参与调控杨树的硝态氮平衡。