树莓SSR反应体系的优化及应用

编号 zgly0000773318

文献类型 期刊论文

文献题名 树莓SSR反应体系的优化及应用

学科分类 220.20;森林培育学

作者 张玉平  潘青华  金万梅  孥少守  许奕华  姜明  韩振海 

作者单位 中国农业大学农学与生物技术学院  北京市农林科学院林业果树研究所 

母体文献 中国农业大学学报 

年卷期 2011,16(6)

页码 58-63

年份 2011 

分类号 S663.2 

关键词 树莓  SSR  体系优化  应用 

文摘内容 本研究主要对树莓SSR-PCR体系进行优化,以‘来味里(Reveille)’红树莓为试材,利用L9(34)正交试验设计和两因素完全随机试验,研究各主要参数的适宜浓度,建立适合树莓SSR反应的最佳体系,并通过16个不同的树莓栽培品种对优化后的体系进行验证。结果表明: 各影响因素中,引物浓度的变化对扩增结果的影响最大,优化后的最佳反应体系(25μL)中,Taq DNA聚合酶和DNA最适用量分别为1.0U和30ng;Mg2+、dNTP和引物最适浓度分别为1.5、0.2mmol/L和0.4μmol/L。利用优化后的反应体系和10对SSR引物对16个树莓品种进行PCR扩增,不同品种间扩增结果稳定,多态性位点丰富,共有54个等位位点,表明该体系稳定可靠,适合树莓的SSR分析。