基于RNA-Seq技术的葡萄不同花型新转录本预测和基因结构优化

编号 zgly0001675744

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RNA-Seq技术的葡萄不同花型新转录本预测和基因结构优化

作者 纪薇  焦晓博  罗尧幸  赵伟  郭雯岩  刘榕晨  赵旗峰  马小河 

作者单位 山西农业大学园艺学院  果树种质创制和利用山西省重点实验室  农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室  山西省农业科学院果树研究所 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S663.1 

关键词 葡萄  RNA-Seq  新转录本预测  基因结构优化 

文摘内容 由于葡萄(Vitis spp.)基因组注释的不完善,本文以3个生长时期3种性状葡萄花器官(雌能花、雄花和两性花)为材料提取总RNA进行高通量测序,开展了葡萄新转录本发掘和已注释基因结构优化工作。获得173.41Gb高质量的过滤后的数据(clean data),发掘出839个新转录本,其中697个新转录本得到了注释信息,同时对10 163个已注释基因的结构进行了优化。本研究旨在为后续葡萄基因组学、表型研究和其他生物基因组注释信息的完善提供参考。