龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析

编号 zgly0001674392

文献类型 期刊论文

文献题名 龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析

作者 胡文舜  陈秀萍  郑少泉 

作者单位 福建省农业科学院果树研究所福建省龙眼枇杷育种工程技术研究中心 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年07期

年份 2019 

分类号 S667.2 

关键词 无患子科  龙眼  SSR  转录组 

文摘内容 基于龙眼品种‘香脆’果实的转录组测序数据库,开发龙眼EST-SSR引物,评价其在无患子、红毛丹、荔枝、龙荔等4个近缘属植物上的通用性,并进行无患子科5个属55份种质的遗传多样性分析。在13 934条龙眼Unigene中搜索到SSR位点6 683个,SSR发生频率为47.96%,平均分布距离为4.48 kb;单、二和三核苷酸重复是主要的SSR类型,分别占52.78%、26.25%和20.19%;设计出4 670对SSR引物,随机合成185对不同重复类型的SSR引物进行验证,有效扩增率为78.92%(146对),其中多态性引物占34.25%(50对),条带多态率50%～100%;龙眼多态性引物在无患子属、韶子属、荔枝属、龙荔属等4个近缘属上的转移率分别为38.30%、38.30%、68.09%和74.47%。UPGMA聚类分析显示,55份材料在遗传相似系数0.561处明显地划分为龙眼、龙荔、荔枝、无患子和红毛丹5个大类。