‘库尔勒香梨’自交不亲和S-RNase等位基因全长的克隆与分析

编号 zgly0001566327

文献类型 期刊论文

文献题名 ‘库尔勒香梨’自交不亲和S-RNase等位基因全长的克隆与分析

作者 吕文娟  冯建荣  刘小芳  刘海楠  李文慧  钟颖 

作者单位 新疆石河子大学农学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年05期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S661.2 

关键词 库尔勒香梨  自交不亲和  S-RNase基因  RACE 

文摘内容 ‘库尔勒香梨’是新疆重点发展的特色果树品种之一,具有自交不亲和性。本研究以新疆轮台国家果树资源圃栽培梨品种‘库尔勒香梨’为试材,利用梨S基因的保守序列设计合成的引物:‘FTQQYQ’/‘antiIIWPNV’初步确定‘库尔勒香梨’S-RNase等位基因型后,设计等位基因特异性引物,利用RT-PCR克隆两个花柱S-RNase等位基因cDNA片段,RACE（cDNA末端快速扩增）技术进行cDNA全长克隆,采用BLAST进行序列比对,Protparam等在线软件分析两个S-RNase等位基因的编码蛋白特性。根据NCBI上已登录的63条梨属S-RNase基因的全长序列,用DNAMAN软件对其氨基酸序列进行比对并用MEGA 4.0构建进化树。本试验从‘库尔勒香梨’中克隆得到了S22-RNase（Gen Bank接受号:KX214125）/S28-RNase（Gen Bank接受号:KX214124）等位基因cDNA的全长序列,为分子手段调控梨自交不亲和性状奠定了基础。S22-RNase基因cDNA全长904 bp,ORF（开放阅读框）长684 bp,编码227个氨基酸;S28-RNase基因cDNA全长921 bp,ORF长687 bp,编码228个氨基酸。BLASTP比对显示,这两个基因都具有保守的RNase-T2基因结构,属于RNase-T2家族。预测相对分子质量分别为25.6 k D和25.9 k D,等电点9.36和9.30,都属于亲水性蛋白。进化分析表明,‘库尔勒香梨’的S22-RNase和S28-RNase处在不同的两个分支上,表明两基因亲缘关系较远。