毛竹甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的克隆与序列分析

编号 zgly0000721134

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的克隆与序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 杨洋  张智俊  罗淑萍 

作者单位 浙江农林大学亚热带森林培育技术国家重点实验室培育基地  新疆农业大学 

母体文献 经济林研究 

年卷期 2010,28(3)

页码 7-13,24

年份 2010 

分类号 Q943.2 S795.7 

关键词 生物信息学  毛竹  甘油醛-3-磷酸脱氢酶  基因克隆 

文摘内容 为了分离毛竹抗逆相关基因,利用RT-PCR和RACE技术,从毛竹叶片中克隆出甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因PeGAPDH的全长cDNA序列(GenBank登录号GU356597)。该序列全长1368bp,完整阅读框1013bp,编码一个具有337个氨基酸残基的蛋白。利用生物信息学软件对PeGAPDH蛋白进行了分析,结果表明: PeGAPDH蛋白分子量为36.643kDa,等电点为6.33;该蛋白含有2个保守区,即N端的NAD+结合区和靠近C端的催化功能区。PeGAPDH是一种亲水性、非分泌型蛋白,定位于膜的表面,属于氧化还原酶系,主要在中间产物代谢和能量代谢中起作用。蛋白质进化树的构建结果表明: PeGAPDH与水稻等禾本科植物来自细胞质中的GAPDH蛋白的亲缘关系很近,同双子叶植物的GAPDH则相差较远。