桃FLA家族基因的生物信息学及表达分析

编号 zgly0001540235

文献类型 期刊论文

文献题名 桃FLA家族基因的生物信息学及表达分析

作者 卞坤  邵佳蓉  徐利伟  沈子明  陈伟  杨震峰 

作者单位 上海海洋大学食品学院  浙江万里学院生物与环境学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 S662.1 

关键词 桃  果实  成束域  阿拉伯半乳糖蛋白  生物信息学  表达分析 

文摘内容 从桃基因组数据库筛选出了12个假定的成束状阿拉伯半乳糖蛋白(FLA)基因序列。对其蛋白结构进行分析,结果显示PpFLA7不具有特定的阿拉伯糖或半乳糖糖基化位点,不属于典型的FLA家族。PpFLA6的氨基酸组成和保守域的分布与其他成员相比差别较大。聚类分析结果表明PpFLAs家族可以分为CladeⅠ、CladeⅡ和CladeⅢ3类。利用荧光定量PCR(qPCR)对不同组织和成熟阶段果实中的FLA进行表达分析,发现各个成员在不同时期的组织中差异化表达,其中PpFLA4在果实成熟阶段显著上调表达,暗示其可能在桃果实的成熟阶段扮演重要角色。