柿树的EST-SSR标记开发

编号 zgly0001577105

文献类型 期刊论文

文献题名 柿树的EST-SSR标记开发

作者 王静  颜芹  王洁  黄月娇  闫晓雨  李佳慧  张丽  张萌  薄文浩 

作者单位 北京林业大学计算生物学中心  北京林业大学林木育种国家工程实验室  北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室  北京林业大学生物科学与技术学院  山东省果树研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S665.2 

关键词 柿树  EST-SSR  引物开发 

文摘内容 柿树是中国重要经济树种。为了开发柿树SSR标记,从NCBI的EST数据库中共下载14198条柿树EST序列,经过去冗余处理和SSR位点搜索,共筛选到1 320条EST-SSR序列可以用于引物设计。实验中随机选取了314对引物进行合成和筛选,共有127对引物成功扩增出多态性扩增条带,加上从已发表的柿子SSR引物中筛选出的14对多态性较高的引物,共利用141对引物,通过SSR分型检测数据分析,获得了可用于模型分析的异源六倍体柿树全同胞家系共141套分子标记的数据。柿树是一种六倍体树种,多态性标记的开发在柿树的遗传学研究和分子育种上将会有众多的应用,能够促进正对六倍体物种的遗传分析模型的开发,也将对一系列重要的六倍体农作物(小麦,甘蔗,棉花等)的研究有推动作用。