毛竹小RNA高通量测序及病毒分析

编号 zgly0000913963

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹小RNA高通量测序及病毒分析

学科分类 220.1070;森林植物学

作者 范春节  王晖  卢孟柱 

作者单位 中国林业科学研究院林业研究所  林木遗传育种国家重点实验室  中国林业科学研究院热带林业研究所  NERC /Centre for Ecology and Hydrology (CEH) 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2014(3)

页码 335-340

年份 2014 

关键词 毛竹  高通量测序  小RNA  RTBV病毒 

文摘内容 以毛竹叶片为材料,采用小RNA高通量测序结合生物信息学对小RNA数据库进行组装,进一步分析了毛竹中存在的病毒和类病毒,并采用RT-PCR和RACE进行验证。结果表明:在竹子样品中存在水稻东格鲁病毒(RTBV),覆盖率达到91.0%。在毛竹样品中扩增得到1 992 bp RTBV病毒类似序列,占其基因组的24.9%。RTBV病毒在多个毛竹样品中存在且不存在多态性。RTBV病毒可能是一个古老的植物病毒,在进化过程中禾本科植物将其序列整合到基因组中来防御RTBV病毒的浸染。