刺五加法尼基焦磷酸合酶基因的克隆、生物信息学及表达分析

编号 zgly0000798144

文献类型 期刊论文

文献题名 刺五加法尼基焦磷酸合酶基因的克隆、生物信息学及表达分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 邢朝斌  龙月红  何闪  粱能松  李宝财 

作者单位 河北联合大学生命科学学院 

母体文献 中国中药杂志 

年卷期 2012(12)

页码 1725-1730

年份 2012 

分类号 R373.21 

关键词 刺五加  法尼基焦磷酸合酶  克隆  表达分析 

文摘内容 目的: 克隆刺五加的法尼基焦磷酸合酶( farnesyl diphosphate synthase, FPS )基因, 并对其进行生物信息学和表达分析。方法: 采用eDNA末端快速扩增(rapid amplifieation of cDNA ends, RACE)技术克隆刺五加FPS基因的全长cDNA序列。运用生物信息学方法对该基因进行分析, 预测其编码蛋白的结构与功能。并通过RT—PCR法检测FPS在不同器官中的表达情况。结果: 刺五加FPS基因的cDNA全长为1499bp, 开放阅读框长1029bp, 编码342个氨基酸的蛋白, 包含2个富含天冬氨酸(DDXXD)的保守功能域。FPS蛋白无跨膜区域, 定位于细胞质中。RT—PCR的结果显示, 刺五加FPS基因在各器官中均有表达, 但表达量具有显著差异(P〈0.05)。结论: 首次分离并报道了刺五加FP5的cDNA克隆, 并证实其在不同器官中的表达量不同, 为进一步研究FPS对刺五加皂苷合成的影响和表达调控奠定了基础。