LncRNA在柑橘木虱与黄龙病病原菌互作中的差异表达分析及验证

编号 zgly0001690171

文献类型 期刊论文

文献题名 LncRNA在柑橘木虱与黄龙病病原菌互作中的差异表达分析及验证

作者 陈梦瑶  曹征鸿  贺康  梅洋  魏圣飞  肖花美 

作者单位 宜春学院生命科学与资源环境学院江西省作物生长发育调控重点实验室  浙江大学昆虫科学研究所农业农村部作物病虫分子生物学重点实验室 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 S436.66 

关键词 长链非编码RNA  柑橘木虱  黄龙病病原菌  RNA-Seq  验证 

文摘内容 为明确柑橘黄龙病的唯一自然传播媒介——柑橘木虱Diaphorina citri的长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）是否参与调控黄龙病病原菌Candidatus Liberibacter asiaticus（CLas）的侵染及复制,采用生物信息学预测及PCR扩增方法进行lncRNA的预测、特征分析、验证及差异表达分析。结果显示,柑橘木虱的13个转录组RNA-Seq数据中共有10 192个lncRNA基因,对应15 747条lncRNA转录本;与蛋白质编码基因相比,柑橘木虱lncRNA具有更少的外显子数量和更短的转录本长度;随机选取的10条lncRNA基因中,有7条lncRNA基因在无菌柑橘木虱广州品系或赣州品系中有表达,其中1条lncRNA基因TCONS00034665在无菌广州品系和无菌赣州品系中存在差异表达;带菌和无菌柑橘木虱成虫中预测获得2个差异表达的lncRNA基因TCONS00096118和TCONS00234564,实时荧光定量PCR验证发现TCONS00234564与预测结果一致,在带菌柑橘木虱成虫中高表达。表明lncRNA参与了黄龙病病原菌与寄主柑橘木虱的互作。