极小种群馨香玉兰特异性单核苷酸多态性位点开发

编号 zgly0001745021

文献类型 期刊论文

文献题名 极小种群馨香玉兰特异性单核苷酸多态性位点开发

作者 张涛  李学  张竞  印轩鹏  贺水莲 

作者单位 云南农业大学园林园艺学院 

母体文献 西部林业科学 

年卷期 2022,51(4)

页码 68-74

年份 2022 

分类号 S718.46  Q949.747.1 

关键词 馨香玉兰  特异性单核苷酸多态性  遗传多样性  简化基因组测序技术 

文摘内容 在馨香玉兰全基因组范围内进行特异性单核苷酸多态性(SNP)位点开发,为馨香玉兰濒危保护以及资源利用提供理论依据。利用以云南省5个野生居群和2个栽培居群共70个个体为材料,进行简化基因组测序技术(SLAF-seq),成功开发了843082个用于馨香玉兰SLAF建库的标签,其中多态性SLAF标记有287843个,通过数据质控,共获得了180650个高度一致性的群体SNP位点,利用SNP位点对馨香玉兰居群进行遗传多样性分析,结果显示:馨香玉兰的观测杂合度H_(o)为0.2697,期望杂合度H_(e)为0.3355,Shannon指数为0.5069,Nei多样性指数为0.3553。结果表明,利用SLAF-seq技术能够实现全基因组范围内的大量SNP标记位点开发,利用大量的SNP位点解析物种的遗传多样性更具准确性和先进性。