水溞基因组P450基因家族的分析

编号 zgly0000618344

文献类型 期刊论文

文献题名 水溞基因组P450基因家族的分析

作者 张云华  王强  张鹏飞  刘静  陈建群 

作者单位 南京大学生命科学学院  安徽农业大学生命科学学院 

母体文献 分子细胞生物学报 

年卷期 2009,42(1)

页码 53-60

年份 2009 

分类号 Q78  TQ457.013 

关键词 水溞  细胞色素P450  正选择  基因转换  基序 

文摘内容 利用水溞基因组mRNA和氨基酸数据库对P450基因进行搜索和分析．结果显示：在水溞基因组中发现71个P450基因，它们分别属于15个P450家族和17个亚家族．是一个典型的多基因家族。以氨基酸相似度大于60％为标准对水溞P450基因进行分组．则71个P450基因中．16个为孤儿基因，不能被归入任何一组：其余55个可归入12个组，其中8个组，包含47条序列适合于正选择和基因转换分析。结果表明：有3个组，含22个基因显著受到正选择压力作用．其中的2个组．含18个基因有正选择概率大于95％的氨基酸位点228E或277T．228E和277T分别位于底物识别位点SRS2和SRS5；有5个组，包含19个基因显示显著的基因转换事件；既显著受到正选择压力作用，又参与基因转换的基因共12个：相反．检测出既没有受到显著的正选择压力作用．又没有基因转换的基因18个。可见．发生基因转换的基因与受到显著正选择的基因有高度的相关性：发生过基因转换的基因中63．2％都受到显著的正选择压力作用，同时，受正选择压力作用的基因中有54．5％发生了基因转换。此外．鉴定出20个不同的基序．其中有5条基序在90％以上的基因中出现。