豌豆蚜基因组P450基因家族的分析

编号 zgly0001390522

文献类型 期刊论文

文献题名 豌豆蚜基因组P450基因家族的分析

作者 张云华  王强  刘静  张鹏飞  陈建群 

作者单位 安徽农业大学生命科学学院  南京大学生命科学学院 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2010年08期

年份 2010 

分类号 S433  Q96 

关键词 豌豆蚜  细胞色素P450  表达序列标签  正选择  基因转换  基序 

文摘内容 细胞色素P450在各种内源和外源物质代谢中起着非常重要的作用。利用豌豆蚜Acyrthosiphon pisum基因组mRNA和氨基酸数据库研究P450基因功能的进化规律。通过生物信息学方法对豌豆蚜全基因组P450进行分析,结果显示:在豌豆蚜基因组中发现69个P450基因,它们分别属于13个P450家族和18个亚家族,是一个典型的多基因家族。进一步将这些基因与豌豆蚜ESTs数据库进行了比对分析,其中39个候选基因有EST证据,证明了这些P450基因在转录水平的真实性。以氨基酸相似度大于60%为标准对豌豆蚜基因组中P450基因进行分组,69个P450基因中,除18个基因序列因差异太大,不能被归入任何一组,其余51个可归入10个组,其中8个组（包含47条序列）适合于正选择和基因转换分析。正选择和基因转换分析结果表明:仅有1个组（含9个基因）显著受到正选择压力作用,正选择概率大于95%的氨基酸位点分别是20T和27N,20T位于底物识别位点SRS1,27N位于D-helix;有3个组（包含8个基因）显示显著的基因转换事件。参与基因转换的基因均为CYP4家族成员,分别是CYP4C,CYP4G和CYP4V亚家族。参与基因转换的成员之间的蛋白相似度较高（70%～95%）,且XM001944991与XM001951794同存在于SCAFFOLD12542上,XM001945510与XM001944057同存在于SCAFFOLD7010上。这可能暗示豌豆蚜P450基因通过基因复制,然后通过基因转换使P450获得新的功能,以适应多变的生存环境。此外,鉴定出20个不同的基序,其中有5条基序在90%以上的基因中出现。