杨树EST-SSR标记的开发

编号 zgly0000639856

文献类型 期刊论文

文献题名 杨树EST-SSR标记的开发

学科分类 220.1070;森林植物学

作者 张新叶  宋丛文  张亚东  杨彦伶  黄敏仁 

作者单位 湖北省林业科学研究院  南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2009,45(9)

页码 53-59

年份 2009 

分类号 S718.46 

关键词 杨树  表达序列标签（EST）  简单重复序列（SSR） 

文摘内容 利用来自美洲黑杨及欧美杨的20023条EST序列,进行EST-SSR标记开发研究。首先对这些EST序列进行序列拼接,然后在非重复序列中发现由二核苷酸至五核苷酸组成的SSR重复序列。共在10816个非重复序列中发现1604个序列含有SSR,占总非重复序列的14.8%。在发现的1918个SSR重复序列中,二核苷酸重复是最丰富的重复类型,占总类型的62.3%。设计合成48对SSR引物,利用6个不同的杨树品种对其进行验证。结果约90%的引物获得扩增产物,58%的引物在6个不同杨树品种中产生多态性分离。另外,还对重复序列的数量及重复类型进行了讨论。