林木多元性状数据QTL区间作图统计分析及其在杨树上的应用

编号 zgly0001632086

文献类型 期刊论文

文献题名 林木多元性状数据QTL区间作图统计分析及其在杨树上的应用

作者 刘粉香  陶申童  吴吉妍  姚丹  童春发 

作者单位 南京林业大学林学院  三江学院 

母体文献 南京林业大学学报(自然科学版 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S792.11 

关键词 多元性状数据  QTL定位  杨树  R语言 

文摘内容 【目的】传统的数量性状基因座(QTL)定位统计分析方法是针对自交系产生实验群体而建立的,不能直接应用到林木这种杂合度较高生长周期较长的异交物种中。针对林木多元性状数据,将传统的QTL区间作图方法应用到林木杂交F1代作图群体中。【方法】考虑分子标记各种可能的分离比以及连锁相信息,建立林木多元性状数据QTL定位统计分析模型,并用R语言编写了相应的计算软件包mvqtlmap。在美洲黑杨和小叶杨杂交F1代群体中,对2014年5月29日至9月24日期间调查的6个时间点树高数据进行了QTL定位分析。【结果】有4个QTL定位在母本美洲黑杨的遗传连锁图谱上,有6个QTL分布在父本小叶杨的遗传连锁图谱上,这些QTL分别位于第1、5、7、9、11和19号染色体上,平均解释0.8%~6.7%的表型方差。【结论】研究结果可为在林木上利用多个性状或多个时间点性状数据进行QTL定位提供统计分析方法及计算工具。所建立的程序包可在网站http://www.bioseqdata.com/mvqtlmap/mvqtlmap.htm上自由下载。