寄生疫霉菌侵染拟南芥相关microRNA靶标调控网络分析

编号 zgly0001411825

文献类型 期刊论文

文献题名 寄生疫霉菌侵染拟南芥相关microRNA靶标调控网络分析

作者 张伟  徐珂  王秦虎  王晓龙  单卫星 

作者单位 西北农林科技大学生命科学学院  西北农林科技大学植物保护学院  西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2011年12期

年份 2011 

分类号 S432.4 

关键词 MicroRNA  生物胁迫  调控网络  GO分析 

文摘内容 【目的】分析寄生疫霉菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,为探明microRNA对应靶标基因的调控网络及其可能的病理学和生物学功能奠定基础。【方法】以寄生疫霉菌(Phytophthora parasitica)和模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,鉴定在病菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,构建其靶标调控网络,并进行Gene Ontology和蛋白质结构域富集分析。【结果】在寄生疫霉菌侵染拟南芥的Solexa测序文库中鉴定39条拟南芥microRNA,筛选出了5个转录因子相关的调控网络;Gene Ontology富集结果表明,在生物学过程中,转录调控相关的基因显著富集;蛋白质结构域富集结果表明,靶基因中转录因子显著富集。【结论】拟南芥响应寄生疫霉菌microRNA靶标基因的功能主要集中在转录因子的调控功能上。