栽培种西番莲完全型SSR的高通量鉴定及标记开发

编号 zgly0001652564

文献类型 期刊论文

文献题名 栽培种西番莲完全型SSR的高通量鉴定及标记开发

作者 吴艳艳  黄伟华  黄永才  刘洁云  田青兰  牟海飞  李小泉 

作者单位 广西农业科学院生物技术研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年20期

年份 2018 

分类号 S667.9 

关键词 西番莲  完全型SSR  高通量  分子标记 

文摘内容 SSR标记具有多态性高、重复性好、共显性等特点,易被用来开发高效简单实用的分子标记。为了丰富栽培种西番莲分子标记的种类和数量,本研究利用生物信息学方法对栽培种西番莲基因组中的完全型SSR进行高通量鉴定,获得13 104个完全型SSR。SSR核心序列结构主要为2～4个碱基,数量最多的为TA、AT、TC和AG,重复次数最高达到20次。利用生物信息学软件开发出12 934对SSR标记,并选取了其中20对标记在西番莲MTX与WJ10中进行了扩增特异性评估,结果显示多态率达60%。西番莲栽培种SSR标记的大量开发为西番莲种质资源的高效利用、品种的遗传改良及分子育种提供了技术支持。