广东割手密SSR遗传多样性分析

编号 zgly0001433941

文献类型 期刊论文

文献题名 广东割手密SSR遗传多样性分析

作者 樊丽娜  李昱  罗青文  劳方业  王勤南  何慧怡  陈月桂  邓海华  李奇伟  齐永文 

作者单位 广州甘蔗糖业研究所  广东省甘蔗改良与生物炼制重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2012年05期

年份 2012 

分类号 S566.1 

关键词 广东  割手密  SSR  遗传多样性 

文摘内容 割手密是甘蔗近缘野生种之一,在甘蔗育种中具有重要地位和作用。本研究采用Genomic-SSR和EST-SSR两种类型分子标记对来自广东各个地区的67个割手密种质进行分析。在20对SSR引物上共检测到341个多态性条带,每个引物上的平均多态性为17.05,其中11个Genomic-SSR的平均多态性为20.82,9个EST-SSR的平均多态性为12.44。广东割手密在Genomic-SSR上的多态性显著高于EST-SSR上的多态性。MantelTest分析表明:通过Genomic-SSR、EST-SSR以及Genomic-SSR+EST-SSR三种方法所计算的试验材料的遗传距离矩阵之间都呈极显著相关(p<0.01),说明应用两种类型SSR获得的各个材料间的遗传关系具有较高的一致性。广东割手密在20对SSR引物上的遗传多样性指数介于0.1064~0.2916之间,平均多样性指数为0.1943;各个材料间的遗传距离为0.0063~0.3082之间,平均为0.1935。UPGMA聚类分析表明:广东割手密之间的遗传关系和地理来源存在一定的相关,由南向北存在较为显著的地理分化。