植物资源与环境学报

编号 zgly0001664136

文献类型 期刊论文

文献题名 植物资源与环境学报

作者 谢欣  钱秋博言  贺莉芳  李林  杨春先  左青青  钱刚 

作者单位 遵义医科大学细胞生物学教研室  黔南民族医学高等专科学校护理系 

母体文献 植物资源与环境学报 

年卷期 2019年01期

年份 2019 

分类号 S567.239 

关键词 千里光  高通量测序  差异表达基因  茎和叶 

文摘内容 以千里光（Senecio scandens Buch.-Ham. ex D. Don）强抗菌性植株SC-32为研究对象,分别提取其茎和叶的总RNA,经质量检测合格后构建cDNA文库,利用Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台对千里光茎和叶的cDNA文库进行转录组测序,筛选差异表达基因,并运用Nr、Swiss-Prot、KEGG和COG数据库对差异表达基因进行功能分析。结果表明:从千里光茎和叶的cDNA文库中分别获得26 147 016和26 996 119个clean reads,Q30值分别为95.17%和94.74%,说明其转录组测序结果良好。从千里光的茎和叶中共筛选到10 991个差异表达基因,以茎中差异表达基因的表达量为准,叶中上调的差异表达基因有5 542个,下调的差异表达基因有5 449个。千里光的茎和叶中共有7 683个差异表达基因被GO功能注释成生物过程、细胞组分和分子功能3个大类53个亚类,且这些差异表达基因与信号传导途径、次生代谢过程、细胞组分合成和酶催化活性等密切相关。KEGG代谢通路分析结果表明:共有4 527个差异表达基因,涉及50个代谢通路,主要参与碳代谢、氨基酸生物合成及淀粉和蔗糖代谢。研究结果显示:千里光茎和叶的差异表达基因具有器官特异性,并且,其茎和叶的分化和形成与多糖和蛋白质累积密切相关。