北苍术转录组分析及倍半萜类生物合成关键基因挖掘

编号 zgly0001715714

文献类型 期刊论文

文献题名 北苍术转录组分析及倍半萜类生物合成关键基因挖掘

作者 赵建华  赵重阳  孙成振  史凤玉  陈丽娜  郑金双 

作者单位 河北科技师范学院农学与生物科技学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年07期

年份 2020 

分类号 S567.239 

关键词 北苍术  转录组  代谢通路  倍半萜  qRT-PCR 

文摘内容 倍半萜类化合物是北苍术主要活性成分及质量控制指标成分。为研究北苍术倍半萜类化合物生物合成通路,利用Illumina HiSeqTM 2000 150PE高通量测序平台对北苍术根茎进行转录组测序,得到8.86 G数据, 59 065 569条高质量reads。Trinity组装获得50 330条条带,平均长度1 214 nt。所有条带在NR、NT、Pfam、KOG、Swissprot、KEGG、GO数据库中得到注释,按GO功能分类将其归为3大类53个分支; KEGG分析发现共有11 235条条带参与130个KEGG标准代谢通路, 421条条带参与21个次生代谢标准通路,其中14条条带参与MVA途径关键酶的生物合成, 12条条带参与MEP途径关键酶的生物合成。实时荧光定量PCR (qRT-PCR)揭示倍半萜类合成关键基因FPPS、HMGR和DXS在北苍术不同器官中均有表达,在茎、根茎、花和越冬芽中相对表达量较高,且HMGR、DXS基因的相对表达量高于FPPS基因。本文为北苍术倍半萜类生物合成途径和分子调控机制的研究提供参考。