香蕉叶片响应盐胁迫转录组分析

编号 zgly0001566269

文献类型 期刊论文

文献题名 香蕉叶片响应盐胁迫转录组分析

作者 吉福桑  李元元  唐露  王文昌  李新国 

作者单位 海南大学园艺园林学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S668.1 

关键词 巴西蕉  转录组  盐胁迫 

文摘内容 通过利用新一代高通量测序手段——转录组测序(RNA-Seq)技术研究巴西蕉(Musa paradisiaca)叶片在60 mmol/L NaCl人工模拟盐胁迫0、12 h、24 h不同时间点的转录组分析。结果表明:盐胁迫12 h上调和下调的DEGs(differential-expressed genes)分别为2 938个和2 727个;24 h分别有834个和893个。GO富集分析,差异基因主要在细胞过程、代谢过程、刺激响应、结合以及催化活性等。KEGG分析,差异基因主要涉及代谢途径、光合作用、黄酮类生物合成、苯丙素生物合成等。通过GO和KEGG显著性富集分析发现,NaCl胁迫12 h后差异表达的基因数明显多于24 h胁迫后的差异基因表达数。qRT-PCR验证了DEGs的表达趋势与RNA-Sep测序分析结果的一致,证明了RNA-Sep结果的准确性。本研究通过香蕉叶片转录组分析,为研究香蕉耐盐分子机制提供参考。