朝仓花椒ARF基因家族的鉴定及表达分析

编号 zgly0001715724

文献类型 期刊论文

文献题名 朝仓花椒ARF基因家族的鉴定及表达分析

作者 刘伟  赵懿琛  廖震  赵德刚 

作者单位 贵州大学药学院  贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室  贵州大学茶学院  贵州省农业科学院/国家农业部植物新品种DUS测试贵阳分中心 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年07期

年份 2020 

分类号 S573.9 

关键词 朝仓花椒  生长素响应因子  ARF基因家族  表达分析 

文摘内容 本研究对朝仓花椒进行转录组测序,建立转录组数据库并进行比对和注释,获得朝仓花椒ARF基因家族序列信息,利用MEGA、MEME和DNAMAN等软件进行分析,并研究了部分ARF基因表达特征。结果表明,朝仓花椒共鉴定出23个ARF基因,进化上可分为6类,每组成员数量分别为6、1、7、3、3和3。结构域分析发现,朝仓花椒ARF蛋白具有保守DBD、AuxRE和AUX/IAA结构域,也有部分ARF蛋白仅含有1个或2个结构域。Real-time PCR结果表明,朝仓花椒ARF基因在植株根、茎、叶、花和果中均有表达。