雀科9种鸟类11个线粒体tRNA基因序列及二级结构比较研究

编号 zgly0000335210

文献类型 期刊论文

文献题名 雀科9种鸟类11个线粒体tRNA基因序列及二级结构比较研究

作者 王翔  孙毅  王黎  于业飞  李庆伟 

作者单位 辽宁师范大学生命科学学院.辽宁大连 

母体文献 辽宁师范大学学报: 自然科学版 

年卷期 2004,27(1)

页码 80-84

年份 2004 

分类号 Q959.739  Q951.3 

关键词 线粒体基因  tRNA基因簇  二级结构  系统发育  雀科  二级结构  基因序列 

文摘内容 利用PCR方法对雀科9种鸟类11个线粒体基因组中3个主要的tRNA基因簇, 即IQM(tRNA一tRNA^Ile-tRNA^Gln-tRNA^Met),WANCY(tRNA^Trp-tRNA^Als-tRNA^Asn-tRNA^Gys-tRNA^Tyr)和HSL(tRNA^His-tRNA^Ser(AGY)-tRNA^Leu(CUN)进行扩增和序列测定, 这些tRNA基因序列中可变核苷酸位点占15%, 其中59%出现在环区, 且存在插入核苷酸; 茎区相对保守, 其中一些变异如双链的互补性碱基突变, G-U配对等对于维系tRNA二级结构的稳定性非常重要, 利用11个线粒体tRNA基因全序列, 以鹌鹑为外群构建了雀科9种鸟类的系统发育树, 结果表明: 黄雀与其它物种关系较远; 鵐亚科中灰头鵐与雀亚科关系最近, 而小鵐与三道眉草鵐比较特化。这与根据二级结构特征得出的结论相吻合, 利用茎区序列构建的NJ树在鵐亚科物种的分类地位上存在分歧, 可能是由于核苷酸数目较少, 信息量小, 在解决近缘物种间的分类地位时受到限制, 结合线粒体tRNA基因二级结构特征比较和系统发育分析, 初步认为线粒体tRNA基因二级结构特征对于推断雀科属间的分类地位具有较高的置信度。