猛禽类15种鸟类线粒体tRNA基因序列及二级结构的比较研究

编号 zgly0000331384

文献类型 期刊论文

文献题名 猛禽类15种鸟类线粒体tRNA基因序列及二级结构的比较研究

作者 王翔  孙毅  袁晓东  汤敏谦  王黎  于业飞  李庆伟 

作者单位 辽宁师范大学生命科学学院 

母体文献 遗传学报 

年卷期 2004,31(4)

页码 411-419

年份 2004 

分类号 Q959.7 

关键词 猛禽类  tRNA基因簇  二级结构  系统发育 

文摘内容 利用PCR方法扩增13个猛禽类物种线粒体基因组中3个主要的tRNA基因簇：IQM(tRNA^lle-tRNA^gln-tRNA^Met)、WANCY(tRNA^Trp-tRNA^Ala-tRNA^Asn-tRNA^Cys-tRNA^Tyr。)和HSL(tRNA^His-tRNA^Ser(AGY)-tRNA^Leu(CUN))，测序后结合GenBank已登陆的游隼和普通鵟相应序列探讨猛禽类共15种鸟类的分子系统进化。3个目的片段长度分别为212～214bp、353～362bp、205～208bp，通过比较这些tRNA基因序列和二级结构差异，发现可变核苷酸位点占47％，这些变异中67％出现在环区，且存在插入和(或)缺失。茎区相对保守，其中一些变异如双链的互补性碱基突变、G-U配对等对于维系tRNA二级结构的稳定性非常重要。以夜鹰为外群分别构建了15个猛禽类物种共11个线粒体tRNA基因全序列和茎区序列的NJ树和MP树．其中基于全序列的系统发育树分支具有较高的自引导值，因此该数据集所反映的猛禽类系统发育关系可能更接近真实水平。系统发育分析显示，隼形目鹰科更接近于鸱鹗科而不是隼科，而草鹗科的分类地位也与传统的形态学和DNA-DNA杂交数据的结论存在分歧。比较物种问tRNA基因二级结构发现，部分tRNA基因中的核苷酸插入和缺失特征在科水平具有共同衍征，提示这些特征对于猛禽类科间系统发育关系具有较高的参考价值。