昆虫质型多角体病毒同义密码子使用模式分析

编号 zgly0001447705

文献类型 期刊论文

文献题名 昆虫质型多角体病毒同义密码子使用模式分析

作者 石生林  姜义仁  杨瑞生  刘彦群  赵金莹  秦利 

作者单位 沈阳农业大学植物保护博士后流动站  沈阳农业大学生物科学技术学院  辽宁省昆虫资源工程技术研究中心 

母体文献 应用昆虫学报 

年卷期 2013年04期

年份 2013 

分类号 S476.13 

关键词 有效密码子数  ENc-plot分析  中性绘图分析  对应分析  偏好性密码子 

文摘内容 昆虫质型多角体病毒(cypovirus,CPV)是害虫种群重要调节因子,可用作生物防治剂。本研究采用多元统计分析方法对7种CPV进行密码子使用模式分析,结果表明:CPV密码子使用偏好性较弱,多数基因密码子使用模式受碱基组成影响,少数基因密码子使用模式除碱基组成外还有其它影响因素;中性绘图分析表明碱基组成主要受选择压力影响,受突变影响较小。同一电泳型CPV之间比同一宿主CPV之间共有的偏好性密码子多。CPV基因组内10个基因组片段之间密码子偏好性存在差异。CPV密码子偏好性与宿主昆虫密码子偏好性存在差异,所有CPV与其宿主昆虫共有的偏好性密码子均较少。对应分析进一步证明碱基组成是影响密码子使用的主要因素,不同电泳型CPV具有不同的密码子使用模式。聚类分析表明同一电泳型CPV密码子使用模式相似,同一宿主CPV密码子使用模式差异较大。