珍稀药用植物珠子参的转录组测序及分析

编号 zgly0001000348

文献类型 期刊论文

文献题名 珍稀药用植物珠子参的转录组测序及分析

作者 张绍鹏  金健  胡炳雄  吴亚运  闫祺  曾万勇  郑用琏  张西峰  陈平 

作者单位 武汉轻工大学生物与制药工程学院 

母体文献 中国中药杂志 

年卷期 2015(11)

页码 2084-2089

年份 2015 

关键词 珠子参  转录组  三萜皂苷 

文摘内容 药用植物珠子参的根茎在中国西南区域已有上千年的药用历史,三萜皂苷为珠子参最主要的活性成分。为了探索珠子参根茎中皂苷物质生物合成的分子基础,该文采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序获得珠子参根茎的转录组数据;使用Trinity和TGICL软件实现Unigene的de novo拼接;基于BLAST完成Unigene的蛋白功能注释、KOG功能注释、GO分类和KEGG代谢通路分析。最终获得了短读序15.6 Gb,通过de novo拼接注释得到Unigene 62 240个。