杜仲HDR基因全长cDNA克隆与序列分析

编号 zgly0000817734

文献类型 期刊论文

文献题名 杜仲HDR基因全长cDNA克隆与序列分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 刘攀峰  杜红岩  乌云塔娜  杜兰英  孙志强 

作者单位 中国林业科学研究院经济林研究开发中心 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2013(4)

页码 447-453

年份 2013 

分类号 S718.4 

关键词 杜仲  HDR  基因  序列分析 

文摘内容 以杜仲叶片cDNA为模板,采用反转录RCR及RACE技术分离出HDR基因的cDNA克隆,命名为EuHDR。EuHDR基因cDNA全长1 653 bp,5’端非编码区长82 bp,3’端非编码区长188 bp,编码460个氨基酸,与喜树HDR基因序列相似性最高,达82%;推导EuHDR氨基酸序列中包含转运肽序列(A1-A33)及植物HDR蛋白多个保守的功能位点(A117,A208,A262,A345);EuHDR蛋白二级结构α-螺旋占35.65%,β-折叠占19.78%,螺环结构占44.57%;EuHDR蛋白三级结构为单体形式,呈不规则的三叶草形状;系统进化分析表明EuHDR蛋白与葡萄HDR蛋白的亲缘关系最为接近。