大戟科Lhcb基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析

编号 zgly0000828635

文献类型 期刊论文

文献题名 大戟科Lhcb基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 邹智  安锋  杨礼富  王真辉  袁坤 

作者单位 中国热带农业科学院橡胶研究所 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2013(12)

页码 46-52

年份 2013 

分类号 S718.46 

关键词 大戟科植物  全基因组  Lhcb基因家族  鉴定  分类  进化分析 

文摘内容 基于已公布的基因组和EST数据,研究对蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树4种大戟科植物的Lhcb基因家族进行系统鉴定,并在此基础上分析其基因结构与进化关系。结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有10、10、13和15个Lhcb基因,分属于Lhcb1、Lhcb2、Lhcb3、Lhcb4、Lhcb5、Lhcb6、Lhcb7和Lhcb8等8个亚家族,每个亚家族包含1～4个成员不等,基因的内含子数目在0～5个之间,部分基因还存在可变剪接形式。进化分析显示,Lhcb1、Lhcb4、Lhcb5和Lhcb7亚族早于单细胞的藻类中就已产生,Lhcb3和Lhcb6亚族在光合生物向陆地进化后产生,Lhcb2亚族存在于高等植物中,Lhcb8亚族则为双子叶植物所特有;Lhcb1亚族在所分析的4种大戟科植物中均出现了基因扩增,Lhcb2和Lhcb5亚族在木薯和橡胶树中出现了扩增,而Lhcb3和Lhcb6亚族仅在橡胶树中出现了扩增。