芸薹属作物EST-SNP的发掘与分析

编号 zgly0001390788

文献类型 期刊论文

文献题名 芸薹属作物EST-SNP的发掘与分析

作者 李雪姣  张耿  顾爱侠  轩淑欣  王彦华  赵建军 

作者单位 河北农业大学园艺学院  浙江大学农业与生物技术学院作物所 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2010年06期

年份 2010 

分类号 S33 

关键词 芸薹属  序列表达标签(EST)  单核苷酸多态性(SNP)  分子标记 

文摘内容 芸薹属作物是十字花科中重要的蔬菜和油用作物,经济价值和食用价值比较高。本研究通过生物信息学手段,从3个芸薹属物种EST序列中获得了大量的SNP和Indel资源,对SNP与EST的数量及拼接结果之间的关系、SNP碱基置换的偏好性、Indel碱基数量与发生频率之间的关系进行了分析。分析结果对深入研究芸薹属基因组特点具有一定的参考价值,为进一步通过试验验证预测的SNP位点、开发该作物高通量SNP分子标记奠定了基础。