森林草莓MYB家族鉴定及生物信息学分析

编号 zgly0001669706

文献类型 期刊论文

文献题名 森林草莓MYB家族鉴定及生物信息学分析

作者 袁华招  于红梅  夏瑾  庞夫花  陈晓东  赵密珍 

作者单位 江苏省农业科学院果树研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2019年03期

年份 2019 

分类号 S668.4 

关键词 草莓  MYB  花药发育 

文摘内容 为研究草莓MYB基因家族,采用生物信息学方法检索森林草莓(Fragaria vesca L.)基因组中MYB基因,并对其基因结构、蛋白保守结构域、染色体定位、基因进化及花药发育过程中表达水平进行分析。结果表明,草莓基因组中可能含有105个R2R3-MYB、4个MYB3R、1个MYB4R基因,它们不均匀分布在7条草莓染色体上,其中5号染色体上数量最多为26个,部分基因在染色体上形成基因簇。理化分析发现这些MYB蛋白长度和大小差异较大,但均具有保守的R2和R3型结构域,R重复单元均含有特征性的氨基酸,包括最保守的有序间隔出现的色氨酸(W)残基。通过系统进化关系和基因结构信息,草莓MYB基因家族被分成了34个亚组(A1～A34),同时利用拟南芥基因功能预测草莓中对应的直系同源基因的功能,结果表明草莓MYB基因家族参与调控黄酮物质合成、细胞发育、生物/非生物胁迫。花药发育过程中表达水平分析发现FvMYB2、FvMYB85、FvMYB74、FvMYB28在花药发育的5个时期中表达量逐渐升高,尤其是发育后期表达量较高,表明这些基因可能调控花药发育过程。本研究结果为草莓MYB基因家族的功能研究提供参考。