枸杞基因组微卫星特征分析

编号 zgly0001007090

文献类型 期刊论文

文献题名 枸杞基因组微卫星特征分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 党少飞  王占林  张得芳  樊光辉 

作者单位 青海大学 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2016(1)

页码 97-102

年份 2016 

关键词 枸杞  基因组  HiSeq2500  微卫星  RAD标记 

文摘内容 利用Illumina HiSeq2500高通量测序技术对枸杞大麻叶品种进行简化基因组测序,对得到的序列利用生物信息学手段进行拼接后查找SSR。结果表明:共获得14 733个重复单元长度为2~6碱基的微卫星重复序列。其中3碱基重复的微卫星单元最为丰富,共9 799个,占66.5%;其次是2碱基重复类型(4 042个)和4碱基重复类型(519个),分别占重复序列总数的27.4%和3.5%;另外5碱基重复281个,6碱基重复92个,分别占重复序列总数的1.9%和0.6%。