悬钩子属DNA条形码通用序列的初步筛选

编号 zgly0001706355

文献类型 期刊论文

文献题名 悬钩子属DNA条形码通用序列的初步筛选

作者 巫伟峰  沈玺龙  陈哲  杨鼎元  李永霞  王瑶  张群英 

作者单位 贵州省植物园  中国科学院庐山植物园 

母体文献 植物研究 

年卷期 2020年02期

年份 2020 

分类号 Q943 

关键词 悬钩子属  DNA条形码筛选  物种鉴定  matK  trnH-psbA 

文摘内容 为了建立悬钩子属(Rubus)植物的DNA条形码分子鉴定技术,筛选获得适用于悬钩子属植物的通用条形码序列。该研究基于Gen Bank数据对ITS、ITS2、mat K、rbc L、trn H-psbA、trn L-trnF 6个DNA条形码序列进行了遗传变异、barcoding gap、建树等评估分析。结果显示,trn H-psbA、mat K、rbc L、rtn L-trnF的种内变异与种间变异差异较大,变异分辨率分别为97. 32%、83. 33%、79. 07%、64. 95%,存在较大的barcoding gap; NJ一致树分析显示,mat K的单系性比例最高(67%),其次为trn H-psbA(64%),rtn L-trnF(43%),rbc L(30%)。结果表明,悬钩子属植物的mat K与trn H-psbA序列种内变异与种间变异差异较大,能较好地区分不同物种,具有较大的鉴定潜力。建议将mat K和trn H-psbA作为悬钩子属植物鉴定的核心条形码序列,rtn L-trnF、rbc L作为辅助条形码序列。