两个叶绿体基因位点的DNA条形码在桉属种间鉴定中的应用

编号 zgly0001371027

文献类型 期刊论文

文献题名 两个叶绿体基因位点的DNA条形码在桉属种间鉴定中的应用

作者 王以红  陶晓瑜  刘海龙  陈晓明  邱英雄 

作者单位 广西壮族自治区林业科学研究院  浙江大学生命科学学院  植物系统与进化实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2009年11期

年份 2009 

分类号 S792.39 

关键词 桉属  叶绿体DNA  rpl2-trnH  trnH-psbA  鉴定  DNA条形码 

文摘内容 对桉属的13个样本(11个种、1个人工杂交种和1个优良无性系)的trnH-psbA基因间隔区的序列进行了比对和分析,13个桉属样本的trnH-psbA长度范围为538～576bp,序列排序的一致性长度为590bp。共检测出了52个变异性状,其中46个变异性状为碱基置换,6个性状为插入或缺失。同时,对桉属11个样本的rpl2-trnH基因间隔区(大单拷贝与反向重复接头)区域进行了序列分析,分析表明,11个桉属样本的rpl2-trnH长度范围为79～149bp,序列排序的一致性长度为154bp。共检测出了19个变异性状,其中4个性状为插入或缺失,15个变异性状为碱基置换。尾叶桉优良无性系的trnH-psbA和rpl2-trnH序列与尾叶桉仅1个位点的碱基置换;与巨尾桉、巨桉进行比较,尾叶桉优良无性系的trnH-psbA序列有27bp的插入,以上4个近缘样本在rpl2-trnH区域的序列差异为12个碱基置换。研究表明,通过两个cpDNA基因位点序列不仅可以将桉属不同种进行区分,而且也可以区分尾叶桉优良无性系与尾叶桉。因此,本研究涉及的两个叶绿体基因组位点序列在建立桉树植物种间鉴定的DNA条形码方面具有潜在的应用价值。