基于线粒体COI基因的青海省44种蚤类的分子鉴定及系统发育分析

编号 zgly0001639037

文献类型 期刊论文

文献题名 基于线粒体COI基因的青海省44种蚤类的分子鉴定及系统发育分析

作者 马英  李海龙  何建  赵延梅  杨汉青  鲁亮  刘起勇 

作者单位 青海省地方病预防控制所  中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 Q963 

关键词 COI基因  蚤类  DNA条形码技术  分子鉴定  系统发育  青海 

文摘内容 【目的】本研究应用DNA条形码技术对青海省部分蚤种进行鉴定,旨在弥补蚤类传统形态分类方法的不足。【方法】通过PCR扩增3总科6科22属44种共182头蚤类标本的线粒体COI基因片段(约600 bp)并进行测序和比对;用K2P模型计算种内及种间遗传距离;以邻接法(neighborjoining,NJ)构建系统发育树。【结果】共测得182条COI基因序列片段(GenBank登录号:MG138154-MG138335);分析可知蚤种内遗传距离0.01%~2.90%,种间遗传距离4%~12%,种间遗传距离显著大于种内遗传距离。系统发育树显示,同一物种的不同个体均形成高支持率的单系,种间分支很明显。【结论】本研究结果表明COI基因可以用于蚤类的快速鉴定。