栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNA ITS序列分析

编号 zgly0001479413

文献类型 期刊论文

文献题名 栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNA ITS序列分析

作者 俞立璇  刘美艳  曹清河  余益成  谢逸萍  罗永海  韩永华  李宗芸 

作者单位 江苏师范大学生命科学学院  整合植物生物学研究所  江苏师范大学  江苏省药用植物生物技术重点实验室  中国农业科学院甘薯研究所徐州甘薯研究中心 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2014年01期

年份 2014 

分类号 S531  Q943.2 

关键词 甘薯  nrDNA ITS  BLAST  遗传距离  系统发育树 

文摘内容 采用核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)序列比较分析了甘薯及其近缘野生种的遗传多样性及系统进化关系,首次报道了栽培种甘薯‘徐薯18’(Ipomoea batatas‘Xushu18’)及其近缘野生种I.triloba(DOM),I.cordatotriloba(MEX),I.nil(PER),I.nil(JPN),I.hederacea Jacq.(USA),I.hederacea Jacq.(HK)和种间杂交种67-1(I.batatas‘Xushu18’×I.hederacea Jacq.)及回交种(67-1×I.batatas‘Xushu18’)的nrDNA ITS序列。序列分析表明,栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNA ITS序列长度为570~600bp。其中,ITS1序列为185~209 bp,GC含量为53.11%~61.83%;ITS2序列为214~226 bp,GC含量为61.21%~72.89%;5.8S序列均为165 bp,GC含量为54.55%~55.76%。此外,栽培种甘薯及其近缘野生种ITS序列信息位点均集中在ITS1和ITS2区;与其他甘薯属植物相比,I.wrightii ITS2的末端缺失了6~8个碱基。系统进化分析表明,栽培种甘薯‘徐薯18’(I.batatas‘Xushu18’)和野生种I.triloba、I.cordatotriloba、I.lacunosa、I.trifida的亲缘关系较近,与I.wrightii、I.pes-tigridis、I.grandifolia、I.nil、I.hederacea Jacq.、I.purpurea的亲缘关系较远;杂交后代与栽培种甘薯‘徐薯18’(I.batatas‘Xushu18’)亲缘关系较近,与野生种父本I.hederacea Jacq.的亲缘关系较远。