基于线粒体COⅠ基因的齿小蠹属昆虫DNA条形码研究

编号 zgly0001433521

文献类型 期刊论文

文献题名 基于线粒体COⅠ基因的齿小蠹属昆虫DNA条形码研究

作者 常虹  郝德君  肖荣堂  刘勇  钱路  安榆林  杨晓军 

作者单位 南京林业大学森林资源与环境学院  吴江出入境检验检疫局  江苏出入境检验检疫局 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2012年09期

年份 2012 

分类号 S433.5 

关键词 齿小蠹属  DNA条形码  线粒体COⅠ基因  遗传距离  系统发育树 

文摘内容 齿小蠹属(鞘翅目:小蠹科)昆虫是植物检疫中经常截获的类群,为探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因的特定区段作为DNA条形码快速准确鉴定齿小蠹种类的可行性,以齿小蠹属昆虫为研究对象,测定分析了线粒体COⅠ基因462bp碱基序列。序列分析结果显示:变异位点为259个,保守位点203个,简约信息位点181个,自裔位点78个。所有位点中,A,G,C和T碱基平均含量分别为30.7%,16.5%,17.0%和35.8%。A+T含量较高,为66.5%,明显高于G+C含量,表现明显的A+T碱基偏嗜,且A与T含量相当,符合昆虫线粒体基因碱基组成的基本特征。转换与颠换结果显示:该段序列未达到饱和,可以得到准确的进化分析。利用Kimura2-parameter模型分析遗传距离得到,同物种间的遗传距离介于0.002～0.007之间,不同种间的遗传距离介于0.056～0.431间,平均遗传距离为0.199,说明该段序列能够区分不同物种。基于COⅠ基因序列构建的邻接法系统发育树(NJ树)显示,同一物种聚为同一小支,且分支自展值均为100%;近缘种能聚集在一起,且置信度很高(≥97%)。结果表明应用基于COⅠ基因片段的DNA条形码进行齿小蠹属昆虫分类鉴定具有可行性。