不同提取缓冲液对红树林土壤DNA提取品质的影响

编号 zgly0000650289

文献类型 期刊论文

文献题名 不同提取缓冲液对红树林土壤DNA提取品质的影响

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 蒋云霞  郑天凌 

作者单位 南方医科大学公共卫生与热带医学学院环境卫生学系  厦门大学生命科学学院 

母体文献 热带海洋学报 

年卷期 2011,30(2)

页码 87-93

年份 2011 

分类号 P714.4 

关键词 红树林土壤  DNA提取  DNA产量  腐殖酸  提取缓冲液 

文摘内容 针对1种典型的酸性、高有机质含量类型土壤——红树林土壤,从DNA产量、DNA纯度、土壤腐殖酸类物质的提取量以及DNA提取物PCR(polymerase chain reaction)扩增反应的敏感度等方面比较了不同提取缓冲液对土壤DNA品质的影响。结果表明,酸性SDS(sodium dodecyl sulfate)提取缓冲液所获得的土壤DNA产量及纯度均较低;PVP(polyvinylpyrrolidone)提取缓冲液所获得的土壤DNA产量较高,但土壤腐殖酸类物质的提取量亦远高于其他提取缓冲液;酸性SDS提取缓冲液及PVP提取缓冲液所获得的土壤DNA提取物即使稀释到10？3量级亦不能获得目的基因PCR扩增条带。PVPP(polyvinylpolypyrrolidone)提取缓冲液及CTAB(cetyltrimethylammonium bromide)+PVPP提取缓冲液所获得的土壤DNA产量较PVP提取缓冲液低,但其纯度较高,并且其纯度随提取缓冲液中PVPP浓度的升高而提高;当2%PVPP提取缓冲液及CTAB+PVPP提取缓冲液所获得的土壤DNA提取物分别稀释到10？2及10？1量级时,均能获得PCR扩增条带。综上所述,酸性提取缓冲液及PVP提取缓冲液不适用于酸性、高有机质含量类型土壤DNA的提取,而2%PVPP提取缓冲液及CTAB+PVPP提取缓冲液均能提高此类土壤DNA的提取品质。